Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A1P32418 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC8A1P32418 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms