Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BRS3P32247 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BRS3P32247 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BRS3P32247 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRS3P32247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms