Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCKBRP32239 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKBRP32239 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms