Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASQ1P31415 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms