Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5DP30049 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP5DP30049 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5DP30049 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms