Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CD40LGP29965 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms