Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SERPINB3P29508 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINB3P29508 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINB3P29508 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms