Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHB2P29323 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHB2P29323 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms