Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD34P28906 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD34P28906 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD34P28906 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD34P28906 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD34P28906 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CD34P28906 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms