Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
POLD1P28340 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD1P28340 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD1P28340 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLD1P28340 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLD1P28340 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD1P28340 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD1P28340 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD1P28340 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLD1P28340 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLD1P28340 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLD1P28340 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD1P28340 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD1P28340 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD1P28340 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD1P28340 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLD1P28340 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLD1P28340 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLD1P28340 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLD1P28340 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD1P28340 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD1P28340 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD1P28340 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLD1P28340 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLD1P28340 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLD1P28340 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLD1P28340 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLD1P28340 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms