Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMB9P28065 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB9P28065 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms