Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTNNA2P26232 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTNNA2P26232 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms