Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GADD45AP24522 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GADD45AP24522 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms