Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND1P24385 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCND1P24385 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCND1P24385 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCND1P24385 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCND1P24385 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCND1P24385 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCND1P24385 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCND1P24385 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCND1P24385 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND1P24385 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND1P24385 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCND1P24385 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms