Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4BP23588 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF4BP23588 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms