Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ME2P23368 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ME2P23368 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ME2P23368 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME2P23368 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME2P23368 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME2P23368 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME2P23368 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME2P23368 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ME2P23368 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms