Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTNP21246 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTNP21246 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTNP21246 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTNP21246 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTNP21246 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTNP21246 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTNP21246 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTNP21246 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTNP21246 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTNP21246 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms