Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPN3P20807 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms