Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTF3P20783 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTF3P20783 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTF3P20783 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTF3P20783 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms