Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP4AP20648 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP4AP20648 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms