Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCNA2P20248 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCNA2P20248 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms