Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TCN1P20061 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCN1P20061 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCN1P20061 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCN1P20061 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCN1P20061 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCN1P20061 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCN1P20061 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCN1P20061 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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