Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NFKB1P19838 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKB1P19838 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKB1P19838 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms