Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR2EP19388 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR2EP19388 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms