Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VCAM1P19320 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VCAM1P19320 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VCAM1P19320 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms