Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD58P19256 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD58P19256 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD58P19256 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD58P19256 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD58P19256 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD58P19256 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD58P19256 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD58P19256 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD58P19256 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD58P19256 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD58P19256 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD58P19256 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD58P19256 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms