Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT15P19012 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT15P19012 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT15P19012 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT15P19012 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT15P19012 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT15P19012 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT15P19012 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT15P19012 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT15P19012 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT15P19012 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms