Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL17P18621 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL17P18621 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL17P18621 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL17P18621 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL17P18621 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL17P18621 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL17P18621 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL17P18621 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL17P18621 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL17P18621 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL17P18621 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL17P18621 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL17P18621 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL17P18621 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms