Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NELFEP18615 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NELFEP18615 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NELFEP18615 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NELFEP18615 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFEP18615 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFEP18615 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NELFEP18615 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NELFEP18615 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NELFEP18615 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NELFEP18615 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NELFEP18615 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NELFEP18615 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NELFEP18615 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms