Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DSPP15924 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DSPP15924 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DSPP15924 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DSPP15924 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DSPP15924 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSPP15924 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DSPP15924 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSPP15924 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DSPP15924 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSPP15924 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSPP15924 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSPP15924 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSPP15924 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSPP15924 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSPP15924 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms