Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHN1P15882 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHN1P15882 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHN1P15882 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHN1P15882 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHN1P15882 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHN1P15882 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHN1P15882 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHN1P15882 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHN1P15882 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHN1P15882 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHN1P15882 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHN1P15882 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHN1P15882 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHN1P15882 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHN1P15882 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHN1P15882 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHN1P15882 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHN1P15882 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHN1P15882 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHN1P15882 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms