Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF2P15336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF2P15336 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATF2P15336 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATF2P15336 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATF2P15336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATF2P15336 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF2P15336 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF2P15336 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATF2P15336 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATF2P15336 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF2P15336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms