Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GSPT1P15170 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSPT1P15170 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSPT1P15170 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GSPT1P15170 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GSPT1P15170 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GSPT1P15170 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GSPT1P15170 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GSPT1P15170 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GSPT1P15170 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GSPT1P15170 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GSPT1P15170 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GSPT1P15170 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms