Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPA3P15088 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPA3P15088 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA3P15088 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA3P15088 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA3P15088 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA3P15088 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA3P15088 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA3P15088 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA3P15088 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms