Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPA1P15085 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPA1P15085 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPA1P15085 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPA1P15085 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPA1P15085 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CPA1P15085 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPA1P15085 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPA1P15085 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA1P15085 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA1P15085 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA1P15085 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA1P15085 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPA1P15085 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPA1P15085 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPA1P15085 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPA1P15085 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA1P15085 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA1P15085 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA1P15085 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPA1P15085 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPA1P15085 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPA1P15085 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPA1P15085 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms