Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFAPP14136 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFAPP14136 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFAPP14136 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFAPP14136 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFAPP14136 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFAPP14136 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFAPP14136 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFAPP14136 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFAPP14136 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFAPP14136 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFAPP14136 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFAPP14136 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms