Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GP1BBP13224 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GP1BBP13224 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms