Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HARSP12081 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HARSP12081 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARSP12081 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARSP12081 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARSP12081 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HARSP12081 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HARSP12081 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HARSP12081 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HARSP12081 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HARSP12081 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HARSP12081 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HARSP12081 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HARSP12081 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HARSP12081 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HARSP12081 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms