Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ODC1P11926 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ODC1P11926 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ODC1P11926 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODC1P11926 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ODC1P11926 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ODC1P11926 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ODC1P11926 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ODC1P11926 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ODC1P11926 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms