Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PYGBP11216 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PYGBP11216 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PYGBP11216 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PYGBP11216 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PYGBP11216 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PYGBP11216 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PYGBP11216 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PYGBP11216 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PYGBP11216 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGBP11216 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGBP11216 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGBP11216 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGBP11216 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PYGBP11216 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PYGBP11216 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms