Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RARAP10276 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARAP10276 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARAP10276 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARAP10276 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARAP10276 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARAP10276 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARAP10276 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARAP10276 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARAP10276 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARAP10276 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARAP10276 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RARAP10276 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms