Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C8orf89P0DMQ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf89P0DMQ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms