Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM6P0DI80 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMIM6P0DI80 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM6P0DI80 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms