Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C4AP0C0L4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4AP0C0L4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms