Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPAP09012 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPAP09012 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPAP09012 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms