Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFHP08603 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFHP08603 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFHP08603 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFHP08603 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFHP08603 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFHP08603 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFHP08603 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFHP08603 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFHP08603 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFHP08603 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFHP08603 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFHP08603 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFHP08603 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFHP08603 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFHP08603 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFHP08603 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms