Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRCP08575 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRCP08575 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRCP08575 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
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