Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP2P08253 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP2P08253 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP2P08253 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP2P08253 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP2P08253 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP2P08253 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP2P08253 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP2P08253 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP2P08253 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP2P08253 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms