Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CSF1RP07333 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSF1RP07333 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSF1RP07333 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms