Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB1P05937 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALB1P05937 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB1P05937 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB1P05937 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB1P05937 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALB1P05937 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALB1P05937 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CALB1P05937 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CALB1P05937 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB1P05937 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB1P05937 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB1P05937 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CALB1P05937 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALB1P05937 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALB1P05937 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB1P05937 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB1P05937 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB1P05937 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms